由于綦良、余公理等各路隋军出师不利，节节败退。

隋炀帝采纳了杨素的推荐，以前江州刺史李子雄为上大将军，并以长孙晟为相州刺史，征集山东兵，与李子雄共同配合镇压谅军。

由于长孙晟的儿子在杨谅部下，所以长孙晟推辞说：&ldo;有男行布，今在逆，忽蒙此任，情所不安。

&rdo;隋炀帝说：&ldo;公著勤诚，朕之所悉。

今相州之，本是齐都，人俗浇浮，易可骚扰。

傥生变动，贼势即张，思所以镇之，非公莫可。

公体国之深，终不可以儿害义，故用相委，公其勿辞&rdo;（《隋书?长孙晟列传》）。

长孙晟奉命出兵，破杨谅，回军后转为武卫将军。

大业三年（607年），炀帝欲北巡至榆林，欲出塞外，陈兵耀武。

因怕启民可汗惊惧，便先派长孙晟到启民可汗部喻旨。

启民可汗闻后，便召所部奚、室韦等数十个部落的酋长齐集迎帝。

长孙晟见此处杂草丛生，欲令启民可汗亲自除之，并让各部酋长看到，使之明白天子之威重。

于是长孙晟手指帐前之草说：&ldo;此根大香。

&rdo;启民可汗闻后说：&ldo;殊不香也。

&rdo;长孙晟又说：&ldo;天子行幸所在，诸侯躬亲洒扫，耘除御路，以表至敬之心。

今牙中芜秽，谓是留香草耳!&rdo;启民可汗这才悟其本意，说：&ldo;奴罪过。

奴之骨肉，皆天子赐也，得效筋力，岂敢有辞？特以边人不知法耳，赖将军恩泽而教导之。

将军之惠，奴之幸也&rdo;（《隋书?长孙晟列传》）。

遂拔佩刀，亲自除草。

其余各部族长见后，争相效之。

启民可汗又发命举国就役开御道，西起榆林，东达于蓟，长3000里，宽百步。

隋炀帝听到此事，对长孙晟的办法非常赞赏。

后长孙晟除淮阳太守，未赴任，复为右骁卫将军。

大业五年（609年），长孙晟去世，时年五十八。

隋炀帝深表悼惜，赐赠甚厚。

少子长孙无忌嗣。

同年，诚心归顺隋朝的启民可汗也去世。

大业十一年（615年）八月，隋炀帝出塞北巡，于雁门为突厥始毕可汗（启民可汗可汗之子，名为咄吉）所围，隋炀帝慨叹道：&ldo;向使长孙晟在，不令匈奴至此&rdo;（《隋书?长孙晟列传》）！

长孙晟长子长孙行布，也多谋略，有父风。

后汉王杨谅起兵，长孙行布奉命守城，遂于豆卢毓等闭门拒杨谅入城，城破遇害。