训练教育部部长初期由园田大佐担任，后期由西俊英中佐接任。

下设卫生兵教育队、特种人员训练队、少年队等。

这个部专门培训从事细菌研究、细菌生产、细菌实验和使用细菌武器的专业人员。

资材部由大谷章一少将任部长。

下设第1仓库、第2仓库、兵器库、菌苗血清库等。

负责贮存与供应各种生产器材设备，同时还承担实验动物的运输和各类菌苗、疫苗的贮存保管。

&ldo;石井&rdo;动物饲养班设置了繁殖细菌传播媒介物的分部，该班班长是石井四郎的三哥石井三男。

诊疗部部长为永山太郎大佐担任。

设门诊部、日本军人家属医院，负责对日本人疾病的预防和治疗。

牡丹江支队又称海林支队、643支队，第一任支队长是池井贞夫，第二任支队长是尾上正男少佐。

设在海林镇东北6公里处的后腰屯（现在的福利屯），编有日本研究人员200名。

当时这里以一条南北道为界，西半部是中国居民，东半部是643支队的营区。

营区占地28万平方米，长方形的四周围有带刺铁丝网。

营舍占据地盘不大，大部分土地为农田。

从海林车站延伸过来的铁路专用线，从该支队营区东部通过。

林口支队又称162支队，第一任支队长是山口吾一，最后一任是癨原秀夫少佐。

设在林口镇和古城镇（现叫新城）之间。

林口是牡佳线和林密铁路的交通枢纽，是东北地区东部的边防要塞。

该支队的人员共226名，其中有3名军医、1名司药官、1名军需官和5名将佐级军官以及60名军人。

下设总务处（计划、经理、庶务），第1处（负责细菌传染的研究和动物培养），第2处（负责防疫给水研究），资材处（负责器材保管，备有甲式滤水器2台、汽车40辆、显微镜20台、大型高压菌槽2个，外有其他物品甚多）。

林口支队的主要任务是配制跳蚤和各类动物。

通常在动物室东面的一个大房间内饲养着从日本运来的白鼠2000余只，由日本人亲自饲养；西面的五个房间装有本地的各种鼠类，由一名日本兵领着四名中国劳工进行饲养。

在其余各房间内，饲养着兔子四五十只，荷兰猪七八十只，还有12条狗。

每隔一个星期，癨原秀夫带领日本研究人员到动物舍给动物抽血，有时在地下室内{{{{{宰杀当地鼠取血。

由于鼠类供不应求，这个支队还不止一次地组织队员到附近各地捕捉黄鼠。

据曾在162支队服役的上野证实：&ldo;在林口支队，捕鼠工作比培养细菌还重要。

我在第2处防疫室工作阶段，曾参加两三个月的捕鼠工作。

外出捕鼠时，不准提部队的名称，穿着便服让人看不出是哪个部队的。